Биотехнологии

Новый эксперимент пролил свет на ключевое событие в эволюции жизни на планете Земля: как именно произошёл эволюционный переход от одноклеточных к многоклеточным формам жизни. Несмотря на то, что, как может показаться, это был естественный этап эволюции, в реальности это было крайне необычное явление: жизнь зародилась на Земле 4-4,3 миллиарда лет назад, и миллиарды лет процветала на планете в одноклеточной форме. Но в какой-то момент что-то произошло, и часть одноклеточных начала формировать всё более и более крупные структуры, некоторые из этих структур приобрели различные функции и, в конечном итоге, развились в первые примитивные животные на планете, имеющие определенные органы и состоящие из миллиардов и даже триллионов разных клеток. Но как именно произошёл этот переход от микро к макро? Что подтолкнуло их к формированию этой необычной структуры — ведь одноклеточные обычно очень успешны сами по себе: и сегодня они присутствуют практически в любых экологических нишах и природных условиях. Эксперимент, опубликованный в 2023 году, даёт некоторые важные ответы на то, как это могло произойти.

В 2002 в журнале Cancer Cell вышла весьма саркастическая статья Юрия Лазебника «Может ли биолог починить радиоприемник, или что я понял, изучая апоптоз».

За 20 лет много изменилось. Биологи создали графический язык SBGN (Systems Biology Graphical Notation) для представления структуры биохимических путей и XML формат SBML (Systems Biology Markup Language) для представления математических моделей.

Кроме самих стандартов, необходимо программное обеспечение, которое их поддерживает. Начиная с 2001 года наша команда разрабатывает программный комплекс BioUML для моделирования сложных биологических систем и анализа биомедицинских данных. UML в его названии – это отсылка к стандарту UML – Unified Modeling Language, языку графического описания для объектного моделирования в области разработки программного обеспечения. Используя ПК BioUML, нашей группой были построены сложные компьютерные модели биологических систем (насколько я знаю, некоторые из них — наиболее сложные в мире для соответствующих систем).

Таким образом, современные стандарты SBGN и SBML и ПК BioUML позволяют биологам создавать схемы и модели биологических систем, вполне сопоставимые по уровню формализации с инженерными схемами.

В новой статье про современные технологии откроем для себя метод DISCOVER-Seq+. Он позволяет с высокой точностью искать офф-таргеты «генетических ножниц» CRISPR/Cas9!

Подготовили обзор приложений искусственного интеллекта в прикладных сферах от сельского хозяйства до медицины и фармы. Обсудим, как машинное обучение, нейросети и компьютерное зрение нашли себя в биологии и биотехе.

Майклу Нгуену за 40, однако он называет свой биологический возраст: от 27 до 29 лет. Нгуен начинает утро с «биозаряда» электромагнитными импульсами, ест один раз в день и принимает много добавок, включая рапамицин, который, по его словам, «обращает старение вспять». Он также пьёт средство от диабета, делает инъекции богатой тромбоцитами плазмы, чтобы остановить выпадение волос, и дремлет в гипербарической камере.

Осенью 2021 года Нгуен открыл «Дом долголетия» — частный клуб, в котором людям обещают, что их жизнь продлится до 120 лет. При этом у них не будет хронических и умственных заболеваний. 

Пожизненное членство стоит $100 тысяч.

Недавно мы делали подробный экскурс в фарму, где рассмотрели классификацию лекарств и ключевые этапы их разработки. А сегодня нырнем в гибридомную технологию получения моноклональных антител — важной группы биологических препаратов и основы таргетной терапии.

Чем занимаются биоинформатики, какие плюсы и минусы этой профессии, произойдет ли AI-революция в сфере обработки данных и по каким траекториям будет развиваться отрасль в 2023 году. Ответы на эти вопросы можно найти в новой обзорной статье Бластима.

С момента своего зарождения фармацевтическая промышленность превратилась в огромную высокотехнологичную отрасль, стоимость которой оценивается в миллиарды долларов и которая продолжает ежегодно расти. На рынке появляются новые высокоспецифичные лекарства, совершенствуются методы передовой терапии. В сегодняшней статье мы рассмотрим, как эволюционировали поколения лекарств, что из себя представляют генная и клеточная терапии, а также разберемся в этапах драг-дизайна.

Генетика - одна из самых динамично развивающихся наук. Мало какая другая дисциплина может поспорить с ней по степени воздействия на качество нашей жизни. И мало какой науке доставалось так сильно, как генетике, за последние сто лет. Больше всего ее корили за евгенику, развитию которой она могла здорово поспособствовать. Сейчас во всем мире действует мораторий на клонирование человека и редактирование его генома. До сих пор не утихла ГМО-истерия.

Но тяжелее всего ей пришлось в СССР и РФ. 

Науку, которая только начала зарождаться, почти полностью уничтожил Трофим Лысенко - безграмотный мерзавец, сгноивший в ГУЛАге самых талантливых ученых-генетиков, чтобы они не мешали продвигать нео-ламаркизм, который принес ему ложную славу и высокий пост. Фактически, он отбросил нашу науку на десятилетия назад. Тяжелейшая потеря, от которой генетика очень долго приходила в себя.

Много десятилетий спустя, уже в РФ, науке снова нанесли жестокий удар - запрет на выращивание ГМО. Это лишило всякого смысла коммерческие разработки ГМО и снова отбросило нас на десятилетия, по сравнению с иностранными успехами. Российские ученые-генетики или уехали за границу, или глобально переквалифицировались.

Не прошло и десяти лет - звучит еще один тревожный звонок: Александр Кудрявцев, директор Института общей генетики, на своем недавнем выступлении, высказался настолько шокирующе антинаучно и нелепо, что снова становится боязно за судьбу этой науки

По сути, ведущий российский генетик — отрицает генетику.

Cyclarity Therapeutics стремится сделать мощные методы лечения сердечно-сосудистых заболеваний и, что наиболее важно, сделать их доступными и недорогими. Их передовая технология циклодекстринов нацелена на атеросклероз, и направлена на устранение накопления неразлагаемого окисленного холестерина, который застревает внутри клеток стенок артерий.

Компания добилась значительного прогресса в выпуске своего препарата циклодекстрин для лечения атеросклероза, испытания на людях должны начаться в этом году. Доктор Мэттью «Оки» О’Коннор, глава компании по научным вопросам Cyclarity, делится своими мыслями о платформе своей компании, её лекарстве и своих мыслях о текущем рынке.

Что такое старение? Мы можем определить его как процесс накопления молекулярных и клеточных повреждений, являющихся следствием нормального метаболизма. В то время как исследователи всё ещё плохо понимают, как метаболические процессы вызывают накопление повреждений, и как накопленные повреждения вызывают патологии, сами повреждения – структурные различия между старой и молодой тканью – классифицированы и изучены очень хорошо. Исправляя повреждения и восстанавливая прежнее – неповреждённое – юное состояние организма, мы реально омолодим его! Звучит очень многообещающе, и так оно и есть. И для некоторых видов повреждений (например, для сенесцентных клеток) показано, что оно работает!

Сегодня в нашей виртуальной студии где-то между холодным дождливым Санкт-Петербургом и тёплым солнечным Маунтайн Вью мы вновь встречаем Обри де Грея. Для тех из вас, кто не знаком с ним, ниже краткая информация.

Доктор Обри де Грей – биомедицинский геронтолог, исследующий идею пренебрежимого старения у человека и основавший SENS Research Foundation. Он получил степень бакалавра компьютерных наук и доктора биологии в Кембриджском университете в 1985 и 2000 годах. Доктор де Грей является главным редактором журнала Rejuvenation Research, членом Геронтологического Общества Америки и Американской Ассоциации Старения, и состоит в редакционных и научных консультативных советах многочисленных журналов и организаций. В 2011 году де Грей унаследовал примерно $16,5 миллионов от своей матери. Из них он выделил $13 миллионов на финансирование SENS.

Покупая одновременно микрозелень и коньяк можно поймать оценивающий взгляд. Не объяснять же каждому, что набор для выращивания приобретается в научных целях. За 98 рублей мы получаем пластиковый контейнер, минеральную вату, пакет семян и инструкцию. «Выдержать в темноте 2 дня… снять крышку… поставить на солнце… периодически поливать». Такие нехитрые действия помогут вырастить небольшое количество полезных растений.

Приблизительно два года назад я приобрел такой набор и успешно вырастил небольшое количество редиса. В это же время ко мне попала книга Уильяма Тексье «Гидропоника для всех». Помимо информации, относящейся к растениям, книга содержит много упрощенных картинок гидропонных установок. Именно Тексье повинен в идее превратить пластиковую коробочку  с минеральной ватой в нечто большее.

Что такое человек? Как работает человеческий мозг? Как устроена биологическая система управления человеческим телом? Является ли человек машиной, как считал Ламетри? Можно ли назвать человека челоботом?