С понедельника, 20 апреля, в Саратовской области начнет действовать пропускной режим.

«В течение недели показатель самоизоляции саратовцев по данным Яндекса составлял 4,2 — 4,3. Это недопустимо. Мы должны пожалеть наших людей, в том числе возрастных людей, соблюдать безусловно режим повышенной готовности и самоизоляции, чтобы защитить наших родителей, наших детей», — заявил [председатель правительства области] Стрелюхин.

Disclaimer: Я высказываю свое субъективное мнение на базе доступных данных. Мнение профессиональных вирусологов и эпидемиологов может отличаться от моего. В любой непонятной ситуации обращайтесь к материалам ВОЗ.

Привет, коллеги. Чем больше роюсь в данных по вспышке коронавируса 2019-nCoV, тем меньше мне нравится происходящее, с учетом предыдущих вспышек аналогичных вирусов. Предлагаю пробежаться по истории прошлых эпидемий и попробовать спрогнозировать дальнейшее течение.

Китайский коронавирус, он же «пневмония Уханя» на неделе стал одной из самых горячих тем. В классической «кто виноват и что делать» меня, традиционно, волнует только вторая часть. Сегодня под катом — статья про дезинфекцию, маски и обеззараживание помещений. Объединил в одной статье несколько заметок из своего телеграм-канала. Кладем в закладки и шлем друзьям!

Последние несколько дней в СМИ появилось много статей с данными о смертности и летальности из-за 2019-nCoV. Люди часто путают эти понятия.

Чего только стоит это интервью в Московском комсомольце:

Ссылка на оригинал
Журналист спрашивает про смертность, собеседник отвечает про летальность! Это простая некомпетентность или в очередной раз "ученый изнасиловал журналиста"?
А в чём разница?

По материалам из телеграм-канала LAB66 и присоединенного к нему чата.

Это время для фактов, а не для страха. Это время для науки, а не слухов. Это время солидарности, а не охоты на ведьм…
директор ВОЗ Tedros Adhanom Ghebreyesus про эпидемию COVID-19

Прошло немного времени с момента публикации моей статьи про респираторную защиту во время эпидемии. За это время, отчасти благодаря активному обсуждению в «приканальном» чате выработалась некоторая система, которой бы я хотел поделится и с читателями хабра. Вынудило меня написать эту статью то, что из-за коронавируса поднялся нездоровый хайп, на волне которого на поверхность начала всплывать совсем не та информация, которая всплывать должна была бы (равно как и внезапно подскочили до х40 раз цены на респираторы, притом все без разбора). Так что нужно расставить точки над i. Под катом читаем про подбор правильного респиратора, про сборку кастомных фильтров и стерилизацию зараженных средств защиты. Ответы на вопросы.


Статью же настоятельно рекомендую «в закладки». Буду рад любому посильному распространению статьи. Краткий итоговый FAQ — в конце статьи.

В декабре-январе 2019 года в провинции Хубей КНР началась вспышка нового заболевания, вызванного, как позже оказалось, штаммом вируса 2019-nCoV. Автор этих строк в начале января находился в Китае а именно в Пекине и посещал соседнюю с Хубей провинцию Шанси. В начале января, по моим ощущениям там не наблюдалось никаких признаков беспокойства: на главной улице столицы провинции Шанси — Сианя проходили массовые народные гуляния и красочные шоу и все общественные места были открыты для посещения. Однако потом все переменилось (я узнал это уже после возвращения), власти Китая отдали распоряжение на закрытие практически всех музеев, общественных и культурных мест. Развитие ситуации после 10 января известно практически всем благодаря обширному освещению в средствах массовой информации. Я бы хотел изложить здесь свое личное мнение относительно потенциальных рисков данной эпидемии и возможных чрезвычайных событий для всех нас. Продолжение под катом.

Translated by authorNovel Coronavirus nCOV/2019-nCoV/NCP/COVID19: Forecasts, Statistics, Protection, News, World: ~2500 [4th reprint, 28.02]

КДПВ

In Chinese
https://hmp.me/cxq9

New news
Updated Charts for 2019-nCov

I started creating my own site, everything new will be on it.

Автор статьи Dave Troy — исследователь онлайн-дезинформации и лжи, а также эксперт в области расчётов, связанных со статистикой болезней. В последнее время он отвечал на многие вопросы о Covid-19 в социальных сетях, пытался опровергнуть заблуждения и ложь. Здесь приведены наиболее распространенные ответы, в надежде, что так эта информация станет более доступной для других.

Дейв не является специалистом в области здравоохранения и медицины, однако приложил дополнительные усилия, чтобы привести все ответы в соответствие с официальными данными и медицинскими рекомендациями.

Почему люди беспокоятся об этом вирусе больше, чем о гриппе?

Каждый человек, зараженный сезонным гриппом, может заразить примерно 1,3 других людей. SARS-CoV-2 (вирус, вызывающий Covid-19) заражает примерно в три раза больше людей (по оценкам, от 2 до 4). Это число называется репродуктивным фактором, или «R0» (иногда произносится как R-ноль). Такая скорость распространения позволяет вирусу очень быстро размножаться, и это может привести к перегрузке и без того загруженной системы здравоохранения.

Есть ощущение, что про эпидемию COVID-19 сейчас вещают из каждого утюга. В этом плане Хабр радует хорошими постами с нормальными источниками и конструктивным обсуждением. Я тоже решила поделиться свежими препринтами на тему экспрессии ACE2 у укуренных мышей, особенностями генетики и эволюции вируса, а также рекомендациями о снижении рисков заболеть. И ещё поскольку мы занимаемся средствами для глаз в лаборатории, меня просто достали вопросами, что помогает. Если коротко — лучше всего помогает пакет на голову.

Вступление

Учитывая всё, что происходит с коронавирусом, может оказаться очень сложно принять решение, что делать прямо сейчас. Стоит ли подождать, пока станет больше информации? Надо ли предпринять что-то уже сегодня? Если да, то что?

В этой статье со множеством графиков, данных и моделей из большого числа источников мы постараемся ответить на вопросы:

• Сколько людей заболеют коронавирусом в вашем регионе?
• Что случится, когда они начнут заболевать?
• Что вы должны делать?
• Когда?

Когда вы закончите читать статью, вы придёте к следующим выводам:

• Коронавирус приближается к вам.
• Он приближается с экспоненциальной скоростью: сперва постепенно, а потом внезапно.
• Это вопрос нескольких дней. Может быть, неделя или две.
• Когда это случится, ваша система здравоохранения будет перегружена.
• Ваши сограждане будут лечиться в коридорах.
• Изможденные медицинские работники сломаются. Некоторые погибнут.
• Им придётся решать, кто из пациентов получит лечение, а кто умрет.
• Единственный способ предотвратить это — социальная изоляция уже сегодня. Не завтра. Сегодня.
• Это значит держать как можно больше людей дома, начиная с сегодняшнего дня.

Если вы политик, общественный деятель или руководитель, у вас есть власть и ответственность, чтобы предотвратить описанное выше.

Сейчас вы можете опасаться: что, если это избыточная реакция? Не станут ли люди смеяться надо мной? Вдруг они разозлятся на меня? Не буду ли я выглядеть глупо? Не лучше ли подождать, пока другие сделают первые шаги? Что, если это слишком навредит бизнесу?

Однако через 2-4 недели, когда весь мир будет закрыт и изолирован, когда окажется, что несколько драгоценных дней социальной изоляции, которые вы организовали, спасли жизни, вас больше не будут критиковать. Люди будут благодарить вас за то, что вы приняли правильное решение.

Итак, давайте разбираться.

Тележка будет медленно толкать своих жертв со скалы в больницу, удобно ожидающую внизу. Они, вероятно, переживут падение (физика мультфильмов!), но потребуют интенсивной медицинской помощи. Если вы потяните рычаг, отправив тележку на нижнюю колею, вы, по крайней мере, сможете выиграть немного времени на подготовку, сократить количество пострадавших и распределить их сильнее, тем самым предотвращая перегруженность персонала больницы. Но черт, это тяжелый рычаг, и тянуть его будет не приятно. (перевод Андрей Дунаев)

Я хочу инициировать создание ситуационного центра, где можно оперативно и централизованно получать информацию ДЛЯ САМОСТОЯТЕЛЬНЫХ выводов о текущем положении дел и принимаемых мерах по поводу:

а) вируса
б) действий правительств
в) действий медиков
г) действий работников и работодателей
д) действий каждого отдельного человека

Я не знаю пока как это грамотно структурировать (а может и вынести на отдельный сайт), но пока что я хочу собрать вместе в кучу тексты и заинтересованных людей. Пишите в комментах ссылки на полезное и рацпредложения.

Первый подтверждённый случай коронавируса в Италии и Южной Корее примерно 20 января. Население — 60М в Италии, 51М — в Южной Корее.

На конец 11 марта 2020г. в Италии 12462 подтверждённых случае и 827 смертей, ~6.6%. В Южной Корее — 7755, 61, ~0.77%. (числа отсюда [1]).

В Италии ситуация хуже почти на порядок (в 8.5 раз). Но почему? Попробуем хотя бы частично разобраться.



Дисклеймер. Я — не медик и не биолог.

В рамках этого текста буду играть за математика с опытом биоинформатики.

Поэтому рассуждения могут оказаться не имеющими отношения к действительности. С другой стороны все факты будут подтверждены пруфлинками.

Если у вас есть факты с пруфлинками — жгите!

! Внимание, я не врач, здесь изложено мое личное мнение. Этот пост НЕ предназначен для оценки ваших рисков и принятия каких-либо решений, касательно вашего здоровья!

Сейчас, когда все страны мира вводят так или иначе запретительные меры, самым важным является правильная оценка летальности болезни. К сожалению, этому почти не уделяется внимание, однако, именно этот фактор должен определять размах запретительных мероприятий. Бесконтрольное распространение карантина способно полностью парализовать мировую экономику (что мы уже наблюдаем) и ухудшить качество жизни и вложения в здравоохранение людей на целой планете. Существует распространенное мнение, что ПЦР диагностика показывает нам точную картину, однако это не так. ПЦР-диагностика — это лишь инструмент имеющий свои ограничения. Если к этому добавляется неправильная выборка в популяции, то мы будем видеть «погоду на Марсе» вместо хоть сколько-нибудь обоснованной оценки.

Паника — худшее, что может случиться во время пандемии. Хабр всегда был и остается местом, где людям важны факты, а не домыслы. Факты такие: коронавирус оказался заразным и в некоторых случаях — смертельным. Государства избирательно закрывают границы, авиакомпании отменяют рейсы, массовые мероприятия переносятся. Лучшее, что можно сделать — как следует подготовиться. Ниже мы собираем самые внятные и полезные статьи, которые выходили на площадке в последнее время. Материал будет дополняться.

„То, что принято без доказательств, может быть отвергнуто без доказательств.“

— Эвклид.

Пост «Коронавирус: почему надо действовать прямо сейчас», как и оригинал перевода собрал много внимания аудитории по вполне понятным причинам. Поскольку всё в мире должно находиться в равновесии, то в рамках этого поста будет дана попытка представить ещё один взгляд на, уже всеобщую, проблему. Задача явным образом опровергнуть или разоблачить вышеприведённый пост не стоит. Каждый самостоятельно может сопоставить противоречащие утверждения.

Действительно, учитывая всё, что происходит с коронавирусом, может оказаться очень сложно принять решение, что делать прямо сейчас. Стоит ли подождать, пока станет больше информации? Надо ли предпринять что-то уже сегодня? Если да, то что?

К сожалению, суждения очень многих, в настоящее время приобретают характер веры. Тем не менее, всем, кто действительно имеет желание понимать природу явления этот материал может дать пищу для размышлений или задать направление для собственных исследований, чтоб помочь детальней разобраться в непростой ситуации и иметь больше шансов для взвешенных решений.

В этом видео со множеством графиков, данных и моделей автор постарается ответить на многие вопросы:

• Какова природа вирусных заболеваний? 3:30
• Каков существующий масштаб ущерба от вирусных заболеваний, когда об этом не было принято повсеместно говорить?
• Какова механика и специфика распостранения острых вирусных респираторных заболеваний и коронавируса в частности? 17:30
• Для кого коронавирус представляет опасность? 23:00
• Как корректно считать и оценивать смертность, летальность и каковы эти значения для коронавирусной инфекции? 30:00
• Какова связь между заразностью и смертностью вирусных инфекций? 35:00
• Про маски. 50:00
• Ретроспективный разбор действий Китая и о пользе карантина. 53:00

Как датасайентисты, мы обязаны уметь анализировать и интерпретировать данные. И мы были очень обеспокоены результатами анализа данных, касающихся covid-19. Наибольшему риску подвержены самые уязвимые категории – пожилые люди и люди с достатком ниже среднего, но для контроля распространения и влияния заболевания все мы должны изменить свое поведение. Тщательно и регулярно мойте руки, избегайте скоплений людей, отменяйте мероприятия и не касайтесь своего лица. В этом сообщении мы объясним причину нашего беспокойства, и расскажем, почему вам также следует беспокоиться. Краткое изложение ключевой информации можно найти в публикации Итана Алли (Ethan Alley) Corona in Brief (автор — президент некоммерческой организации, разрабатывающей технологии для уменьшения риска пандемий).

Содержание:

1. Нам нужна работоспособная медицинская система
2. Это не что-то типа гриппа
3. Подход «Не паникуйте, сохраняйте спокойствие» не помогает
4. Это касается не только Вас
5. Мы должны сделать кривую более пологой
6. Реакция общества имеет значение
7. Мы в США плохо проинформированы
8. Заключение

Модераторы сабреддита «PC Master race» призвали владельцев мощных игровых видеокарт присоединиться к научным облачным вычислениям Стэнфордского проекта Folding@Home, который прямо сейчас занимается расчетом моделей сразу по восьми направлениям для борьбы с COVID-19. Инициативу сообщества Reddit уже поддержала компания Nvidia, которая призвала через твиттер своих потребителей предоставить ученым вычислительные мощности своих видеокарт:


Важно отметить, что сабреддит «PC Master race» не пытается хайпануть на теме коронавируса: поддержка Folding@Home и первый систематизированный мега-тред, посвященный проекту, был опубликован еще 4 месяца назад, когда о коронавирусе даже не слышали. Кроме того, пользователи упоминали F@H в сабреддите на протяжении последних пяти лет.

Как принять участие в коллективных вычислениях, даже если вам плевать на COVID-19 и вы хотите, чтобы побыстрее нашлось лекарство от рака — под катом.

И до коронавируса Москву накрывали эпидемии других вирусов нанося огромный экономический ущерб. Сначала заболевает один, потом второй и потом уже половина офиса и больше. Раньше мы как-то не задумывались, ну болеют и болеют люди, вроде ничего сделать нельзя. Если не задумываться, то конечно нельзя. Но оказалось, что можно и меры работают.

С конца прошлой недели наша PR-директор Таня Комарова оказалась в ситуации, когда карантин на работах и в школах носит уже не добровольный, а обязательный характер. Мы поговорили с ней о том, что происходит, как приспосабливаются люди и чего ждут дальше.


“Мы не предусматривали дома второй home office, поэтому место неудачника выглядит так”, — пишет Таня.

Сам разговор состоялся в субботу 14 марта: днем по московскому, и утром — по каталонскому времени. Все, что случилось потом, мы вынесли в цитаты из переписки с Таней.