Действие сериала «Тайна секретного шифра» происходит в 1945 году. В секретной американской лаборатории, где ведутся разработки атомной бомбы, действует советская агентура. Немцы перехватывают русский код и с помощью уникальной дешифровальной машины его взламывают. Чтобы украсть эту машину и не допустить попадания ценных сведений к врагу, США и СССР посылают своих агентов в Германию, а там к ним присоединяется польский разведчик, работающий под прикрытием.
