Спецназ, 2-й сезон

Группа террористов захватывает самолет Ту-154 и угоняет его в Афганистан, на недавно захваченный аэродром, дабы затем «отпустить» заложников, а на самом деле загрузить в него отряд своих бойцов, после чего самолет «по техническим причинам» сядет в Душанбе, где проходит конференция представителей США и России по борьбе с терроризмом, и рота боевиков сможет наглядно показать ее неэффективность. Однако одним из пассажиров случайно оказался «Хруст», а затем остальная группа, обогнав захваченный самолет на Ту-160, зачищает аэродром посадки и ликвидирует террористов в самолёте, затем прикрывая взлетающий пассажирский самолёт от атаки той самой роты боевиков.

В партии наркотиков, захваченной в Санкт-Петербурге, найден разработанный афганскими террористами вирус «Дыхание пророка». Пока он распространяется только через кровь, но идут усиленные работы по разработке штамма, передающегося воздушно-капельным путем. Группа Платова с вирусологом Фархадовым направляется в Афганистан, дабы захватить документацию по вирусу и образцы вакцины, после чего лабораторию уничтожит авиация. Ситуацию осложнит ранение Хруста, проводник-смертник, заражение вирусом Якута, спасти которого поможет знание Фархадовым Корана наизусть.

На российском блокпосту в Чечне, подвергшемуся нападению боевиков, группа обнаруживает раненого священника, которым оказывается бывший сослуживец Хруста Александр Орлов («Бекас»). Оказывается, несколько лет назад бандиты (террористы- грабители, уходившие от милиции) захватили школу. При штурме с участием Орлова погибла одна из учениц — его дочь, а его жена, не вынеся этого, совершила самоубийство. «Бекас», потерявший все, ушел в монахи. Через некоторое время его отправили на восстановление православного храма в Косово. Вскоре в монастырь прибыл отряд албанских боевиков «Армии освобождения Косова», которые перебили священников и подоспевший патруль французских миротворцев. Глава боевиков пообещал убить оставшегося в живых послушника и сербских женщин и детей, собравшихся в храме, однако послушник с помощью французского полковника (прикинувшегося убитым) уничтожил боевиков.