В начале фильма женщина по имени Аманда Уоллер представляет высшим правительственным чинам США свой проект под названием «Отряд Икс». Супермена больше нет и страна остро нуждается в новых сепергероях. Ими она предлагает сделать самых отъявленных преступников современности. Ее команда злодеев состоит из: сумасшедшей подружки Джокера – Харли Квинн, элитного киллера Дэдшота, бывшего гангстера Эль Диабло, искусного вора Капитана Бумеранга, человека-ящера Крока и наемника Слипкнота. Также у нее под колпаком Чародейка – ведьма, вселившаяся в тело археолога Джун Мун. Аманда владеет сердцем ведьмы и поэтому Чардейка исполняет любой ее приказ. В Джун Мун влюблен самый лучший солдат армии США – Рик Флаг. Его Аманда планирует использовать как командира для своего отряда Икс. В качестве личного телохранителя Рика выступает Катана, японка, обладающая магическим мечом.
Однажды Чародейка высвобождает своего брата, который начинает убивать людей в метро. Чтобы его остановить Аманда посылает туда Чародейку и Рика, но ведьма сбегает и питается энергией брата, чтобы Уоллер не смогла убить ее дистанционно. В результате Мидвей-сити превращается в зону боевых действий. Армия США не может справиться с Чародейкой и ее братом. Самое время для того, чтобы впервые использовать отряд Икс. Для страховки всем преступникам вживляют в шею бомбы, которые позволят Аманде и Рику контролировать их поведение. Также их экипируют и на вертолете доставляют в Мидвей-сити. Рик сообщает отряду, что их задачей является спасение очень важного человека, застрявшего в городе, который захватили террористы.
Вертолет с отрядом сбивают, но команде Рика удается выжить. Однако теперь им приходится продолжить свой путь пешком. Капитан Бумеранг убеждает Слипкнота, что бомбы в их теле это лишь фикция и тот пытается сбежать. Рик нажимает кнопку на своем смартфоне и Слипкнот умирает у всех на глазах. В полуразрушенном городе отряд сталкивается с неизвестными существами, бывшими людьми, которых Чародейка превратила в своих бесстрашных солдат. В итоге им удается добраться до здания, в котором находится их цель.
Пока отряд Икс пробивался через монстров на самый верх здания, Джокер готовил побег для своей ненаглядной Харли. Он пробился к ученому, который отвечал за установку бомб и отключил бомбу Харли. Тем временем отряд узнал, что они спасали Аманду Уоллер. Выйдя на крышу, они ждали вертолет для эвакуации, но оказалось, что он был захвачен Джокером. Харли улетает вместе с Джокером, но их вертолет сбивают. Джокер погибает, а Харли удается спрыгнуть на крышу здания. За Амандой прилетает новый вертолет, который сбивает Чародейка. Аманде удается выжить, но ее захватывают в плен. Чародейка получает свое сердце, и теперь она может закончить создание своей машины для уничтожения всего человечества.
Отряду Икс приходится продолжить свою миссию. Они добираются до места, где Чародейка вместе со своим братом строят машину смерти и нападают на них. Сначала им приходится расправиться с братом. Чтобы его убить своей жизнью пожертвовал Эль Диабло. Харли обманом удается приблизиться к Чародеке и вырвать у нее сердце. Крок бросает взрывчатку в почти завершенную машину смерти и Дэдшот метким выстрелом ее взрывает. Рик Флаг берет сердце Чародейки и раздавливает его, думая, что при этом убивает и Джун. Однако после смерти ведьмы Джун оживает.
К отряду выходит живая Аманда. За эту миссию она прощает всем по 10 лет заключения и исполняет их незначительные просьбы. Например, Дэдшоту позволяют видеться с дочерью, Харли ставят в камеру кофемашину, а Кроку достается телевизор. В конце фильма выживший Джокер прорывается в тюрьму к Харли. В сцене после титров Аманда в обмен на защиту предоставляет Брюсу Уэйну секретные правительственные данные о людях-мутантах.
